フィードバックありがとうございます。以下にて回答させていただきます。

>・ダイレクトメッセージ非公開にも関わらず企業からメッセージが届きました、これは仕様ですか？

現状こちらは仕様となっております。スカウトDMと通常のDMは別扱いとなっており、今後スカウトDMの非公開も対応していく予定です。

>・企業からメッセージが届いたことをiOSアプリで確認出来るが、Web版では「ダイレクトメッセージを公開していません」と出てメッセージを確認できないのは仕様ですか？

こちらは仕様の互換性が取れていないのでバグですね。現在の仕様に合わせてWeb版でも表示するよう対応させていただきます。